Les prix de la Fondation Irv et Helga Cooper apporteront un soutien essentiel 脿 trois initiatives enthousiasmantes en mati猫re de science ouverte. Les laur茅ats de cette ann茅e ont fait preuve d鈥檈xemplarit茅 et de cr茅ativit茅 en proposant des outils et des ressources qui facilitent l鈥櫭ヽhange des donn茅es et la reproductibilit茅. Leur m茅rite particulier fut de rendre accessibles de nouveaux ensembles de donn茅es d茅mographiques, comme celles des personnes d鈥檃scendance africaine 鈥� g茅n茅ralement sous-repr茅sent茅es dans la recherche et les banques de donn茅es 鈥� pour finalement am茅liorer la qualit茅 des soins prodigu茅s aux patients en Afrique et dans d鈥檃utres r茅gions.
Cette ann茅e encore, ces prix ont suscit茅 l鈥檌nt茅r锚t partout dans le monde. Le prix international a re莽u plus de 20 candidatures en provenance de 17 pays. Les projets d茅montraient une impressionnante diversit茅 : cr茅ation de capacit茅s durables pour la neuro-imagerie en Afrique, 茅laboration de normes pour l鈥櫭ヽhange des donn茅es d鈥檌magerie c茅r茅brale, fourniture de bo卯tes 脿 outils pour les enregistrements 茅lectrophysiologiques, recadrage de l鈥櫭﹙aluation par les pairs, cr茅ation de plateformes pour la mod茅lisation de r茅seaux c茅r茅braux complets, mise en commun de donn茅es, etc. Vingt 茅tudiants de huit pays (Australie, France, Pays-Bas, Nigeria, Royaume-Uni, Allemagne, 脡tats-Unis et Canada) ont pos茅 leur candidature aux bourses pour stagiaires.
Les prix de science ouverte du Neuro, parrain茅s par la Fondation Irv et Helga Cooper, sont une initiative de l鈥橧nstitut de science ouverte Tanenbaum du Neuro. Ces prix seront d茅cern茅s le 30 novembre lors du symposium sur la science ouverte en action.
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Prix international 鈥� 80 000 $
La structure des donn茅es d鈥檌magerie c茅r茅brale (BIDS selon l鈥檃cronyme anglais) est une norme de donn茅es mise 脿 disposition pour la communaut茅 mondiale de la neuro-imagerie 鈥� Le comit茅 directeur de BIDS
Ariel Rokem, Universit茅 de Washington
Cyril Pernet, H么pital universitaire de Copenhague, Rigshospitalet
Guiomar Niso, Institut Cajal du Conseil national de la recherche espagnol
Yaroslav Halchenko, Universit茅 de Dartmouth
Robert Oostenveld, Institut Donders pour le cerveau, la cognition et le comportement
D茅cern茅 脿 BIDS, ce prix vient r茅compenser une approche collective de longue date pour normaliser les donn茅es en neuro-imagerie et permettre ainsi leur adoption par un large public. BIDS a jou茅 un r么le fondamental dans de nombreuses initiatives mondiales d鈥櫭ヽhange de donn茅es, et servi de mod猫le pour d鈥檃utres normes. Le comit茅 de s茅lection du prix a 茅galement f茅licit茅 l鈥檕rganisation pour sa constante collaboration avec le monde des neurosciences et pour ses interventions destin茅es 脿 g茅n茅raliser BIDS 脿 d鈥檃utres formes de donn茅es.
Les exp茅riences de neuro-imagerie produisent une multiplicit茅 de donn茅es structur茅es de mani猫re diverse. L鈥檃bsence de normes conduit 脿 des organisations diff茅rentes d鈥檜n 茅tablissement 脿 l鈥檃utre et parfois au sein d鈥檜n m锚me laboratoire, avec pour cons茅quence des malentendus et des erreurs, et un gaspillage des ressources. Qui plus est, la reproductibilit茅 reste m茅diocre, m锚me au sein du laboratoire o霉 les donn茅es ont 茅t茅 recueillies. La aplanit cette difficult茅 en organisant les donn茅es de neuro-imagerie selon un mod猫le simple et facile 脿 adopter. BIDS est une norme commune pour l鈥檕rganisation, la description et l鈥櫭ヽhange de ces donn茅es. Outre un document descriptif des sp茅cifications, elle fournit des applications et des outils aux chercheurs pour int茅grer facilement la norme dans leurs flux de travail actuels, et maximiser la reproductibilit茅 et les possibilit茅s d鈥櫭ヽhange des donn茅es, tout en respectant les bonnes pratiques scientifiques. L鈥檃doption g茅n茅ralis茅e de BIDS a donn茅 une forte impulsion 脿 la recherche. La structure compte maintenant plus de 300 contributeurs dans le monde et une centaine de centres et de projets. Les donn茅es IRM de plus de 45 000 individus sont ainsi mises en commun au format BIDS sur diverses plateformes, et elles totalisent plus de 1 500 citations depuis 2016. En 茅liminant les obstacles 脿 l鈥櫭ヽhange des donn茅es, BIDS a suscit茅 une pl茅thore de projets fond茅s sur les donn茅es en source ouverte partout dans le monde.
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Prix pour les stagiaires
Prix du stagiaire international 鈥� 10 000 $
D茅fi de la segmentation des tumeurs c茅r茅brales en Afrique subsaharienne 鈥� Maruf Adewole, , Lagos, Nigeria
Ce prix r茅compense Maruf Adewole pour son r么le pr茅pond茅rant dans les initiatives visant 脿 renforcer les capacit茅s de recherche dans des collectivit茅s d茅pourvues de ressources. Ses nombreuses contributions 脿 la science ouverte ont englob茅 diverses m茅thodologies fond茅es sur le partage de donn茅es ouvertes, les collaborations 脿 grande 茅chelle et la formation.
Au cours de ses dix ann茅es d鈥檈xistence, le D茅fi de la segmentation des tumeurs c茅r茅brales (BraTS) n鈥檃 jamais pr茅sent茅 de donn茅es provenant de r茅gions mal desservies comme l鈥橝frique subsaharienne.
En collaboration avec le Consortium pour l鈥檃vancement de l鈥櫭ヾucation et de la recherche en IRM en Afrique (sigle anglais ), Maruf Adewole a dirig茅 le BraTS-SSA, le premier ensemble de donn茅es d鈥檌magerie par r茅sonance magn茅tique (IRM) en libre acc猫s sur les cas de tumeurs c茅r茅brales en Afrique subsaharienne. La population d鈥橝frique subsaharienne figure ainsi dans les efforts mondiaux pour cr茅er des outils d鈥檌ntelligence artificielle afin d鈥檃m茅liorer la d茅tection des tumeurs c茅r茅brales et la planification des traitements. Le regroupement et la conservation d鈥檈nsembles de donn茅es diverses recueillies dans les centres de diagnostic africains ont fourni aux chercheurs une ressource pr茅cieuse pour mieux conna卯tre les aspects uniques des tumeurs c茅r茅brales dans les populations africaines. Ces ensembles de donn茅es am茅liorent potentiellement la pr茅cision du diagnostic, la planification du traitement et ses r茅sultats, et renforcent la qualit茅 des soins aux patients en Afrique et dans d鈥檃utres milieux o霉 les ressources sont 茅galement limit茅es.
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Prix du stagiaire canadien 鈥� 5 000 $
脡valuation continue des strat茅gies de d茅bruitage de la connectivit茅 de l鈥檌magerie par r茅sonance magn茅tique fonctionnelle 脿 l鈥櫭﹖at de repos 脿 l鈥檃ide de fMRIPrep et de Nilearn 鈥� Hao-Ting Wang, Centre de recherche de l鈥橧nstitut universitaire de g茅riatrie de Montr茅al
Le prix a 茅t茅 d茅cern茅 脿 Hao-Ting, tant pour ses nombreuses contributions aux logiciels libres facilitant une neuro-imagerie ouverte et reproductible, que pour son engagement continu aupr猫s des collectivit茅s locales et mondiales de la science ouverte.
Ce projet constitue un nouveau point de r茅f茅rence en mati猫re de d茅bruitage des donn茅es d鈥橧RM fonctionnelle, ex茅cutable de mani猫re r茅p茅t茅e pour les utilisateurs de fMRIPrep, un logiciel de pr茅traitement ouvert et populaire. Ce point de r茅f茅rence permet d鈥櫭﹙aluer pour la premi猫re fois le d茅bruitage des connectomes 脿 l鈥檃ide d鈥檜n logiciel contemporain. Il propose un flux de travail ouvert, de l鈥檈nsemble des donn茅es jusqu鈥櫭� la mise en 艙uvre du logiciel. Le projet privil茅gie notamment le cycle de vie du logiciel et les avantages pour la communaut茅 par rapport 脿 une publication individuelle, comme en t茅moigne l鈥檌nt茅gration dans la biblioth猫que logicielle existante, ouverte et largement utilis茅e Nilearn, plut么t que la cr茅ation d鈥檜n logiciel distinct. En vue de fournir des conseils aux utilisateurs de fMRIprep et de d茅montrer l鈥檌mportance d鈥檜ne 茅valuation continue des m茅thodes de recherche, ce travail jette les bases d鈥檜ne infrastructure de recherche reproductible. La pr茅publication mise en ligne sur le service de Neurolibre facilite l鈥櫭﹙aluation continue 脿 l鈥檃venir et d茅montre le potentiel des applications de Neurolibre pour la recherche reproductible. Ce projet de r茅f茅rence a 茅galement servi de prototype d鈥檃pplications de structure de donn茅es d鈥檌magerie c茅r茅brale (BIDS-App) pour produire des s茅ries temporelles et des connectomes pr锚ts pour l鈥檃pprentissage automatique.
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Inscrivez le 30 novembre 2023 dans votre calendrier pour la c茅r茅monie de remise des prix et symposium sur la science ouverte
Cette ann茅e, les prix de la science ouverte de la Fondation Neuro 鈥� Irv et Helga Cooper seront d茅cern茅s en personne lors du Symposium de la science ouverte en action le 30 novembre 2023.
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